Als schriftliches Abiturfach nimmt die Mathematik einen der größten Stellenwerte der gymnasialen Schulbildung ein. Am Gymnasium Weilheim wird sie über alle Jahrgangsstufen unabhängig der Zweigwahl mit der gleichen Intensität unterrichtet. Als Unterrichtswerk findet hierbei der Lambacher Schweizer des Klett-Verlags Verwendung.
Zu Beginn des Schuljahrs werden in den Jahrgangsstufen 8 und 10 des Gymnasiums zentrale Jahrgangsstufentests abgehalten. Diese Vergleichsarbeiten geben Hinweise auf spezifische Stärken und Schwächen der Schülerinnen und Schüler vor dem Hintergrund der landesweit erzielten Ergebnisse und zielen darauf ab, den langfristigen Lernerfolg sicherzustellen.